RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 H2BFMP0C1H6 154 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 ACHEP22303 614 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 MNDAP41218 407 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 CYB561P49447 251 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SRP9P49458 86 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 CARD18P57730 90 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H3AP68431 136 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 GPR176Q14439 515 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 DCAF10Q5QP82 559 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 C10orf128Q5T292 105 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 AGAP6Q5VW22 663 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 TRIQKQ629K1 86 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 RAB43Q86YS6 212 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SERPINA12Q8IW75 414 aa4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 TMEM123Q8N131 208 aa4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 C19orf18Q8NEA5 215 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 OR9K2Q8NGE7 335 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 TMEM106AQ96A25 262 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 RFT1Q96AA3 541 aa4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 HAVCR1Q96D42 359 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 AGAP4Q96P64 663 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SLC22A4Q9H015 551 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SLITRK2Q9H156 845 aa4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 FOXJ3Q9UPW0 622 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 DHDHQ9UQ10 334 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 SEC16AO15027 2179 aa4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TRDN-205ENST00000546248 USP34Q70CQ2 3546 aa4.71□□□□□ -1.65
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TRDN-205ENST00000546248 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.71□□□□□ -1.66
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TRDN-205ENST00000546248 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 P2RY10O00398 339 aa4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 SLC17A2O00624 439 aa4.71□□□□□ -1.66
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TRDN-205ENST00000546248 SULT1B1O43704 296 aa4.71□□□□□ -1.66
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TRDN-205ENST00000546248 CD3GP09693 182 aa4.71□□□□□ -1.66
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TRDN-205ENST00000546248 TGIF1Q15583 401 aa4.71□□□□□ -1.66
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TRDN-205ENST00000546248 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.71□□□□□ -1.66
TRDN-205ENST00000546248 TMEM244Q5VVB8 128 aa4.71□□□□□ -1.66
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