RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537178.5

CLIP1-209, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLIP1, Length 5,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-209ENST00000537178 CDC20Q12834 499 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 VWA2Q5GFL6 755 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 C16orf52Q8NHV5 167 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ACY3Q96HD9 319 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 C12orf57Q99622 126 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 OCIAD1Q9NX40 245 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FCMRO60667 390 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 CALCRP30988 508 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FAM3AP98173 230 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FABP5Q01469 135 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TTC9Q92623 222 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TMEM56Q96MV1 263 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 CHST6Q9GZX3 395 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ICOSLGO75144 302 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TNFRSF1AP19438 455 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ADGRG7Q96K78 797 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 EDEM2Q9BV94 578 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.6□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 SCO1O75880 301 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 GOSR1O95249 250 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 IFI44Q8TCB0 444 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ST6GAL1P15907 406 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 THBS4P35443 961 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 SPCS3P61009 180 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ACVR1Q04771 509 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 KMT5CQ86Y97 462 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 PELI1Q96FA3 418 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FUT3P21217 361 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 DCTDP32321 178 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 KCNAB1Q14722 419 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 IQCJQ1A5X6 159 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 RHOFQ9HBH0 211 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 POMT1Q9Y6A1 747 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 SLC17A2O00624 439 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 CBR3O75828 277 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 MEOX1P50221 254 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 CCR5P51681 352 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 FAM53BQ14153 422 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 Q8IYB0 196 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF596Q8TC21 504 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLIP1-209ENST00000537178 SLC22A20A6NK97 555 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 SHISA7A6NL88 538 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 HRASP01112 189 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 FABP4P15090 132 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 G0S2P27469 103 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 STUMQ69YW2 141 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 UQCC3Q6UW78 93 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 CA13Q8N1Q1 262 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.59□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 H3BP45 60 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 PMCHP20382 165 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 LINC01553A4QN01 128 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 NDUFB3O43676 98 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 EPXP11678 715 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 CAPZBP47756 277 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.58□□□□□ -0.88
CLIP1-209ENST00000537178 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms