RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528020.1

CTSC-205, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-205	ENST00000528020	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ACOT8	O14734	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	SPDEF	O95238	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	LIPF	P07098	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	COX5B	P10606	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	PSKH1	P11801	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	CD200	P41217	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NPY4R	P50391	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	RAB13	P51153	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	STX1B	P61266	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	AQP6	Q13520	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	PCK2	Q16822	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	AGK	Q53H12	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	FSTL3	O95633	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	LCAT	P04180	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	SLC2A1	P11166	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	CPT2	P23786	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	COX7A1	P24310	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ZNF92	Q03936	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ECH1	Q13011	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ASCL2	Q99929	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	FN3K	Q9H479	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020		A0A1W2PQ09	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020		A6NIZ1	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	XKRY	O14609	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	FFAR1	O14842	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-205	ENST00000528020	NXPH3	O95157	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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