RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 DDOSTP39656 456 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 MAP2K3P46734 347 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 BLMHQ13867 455 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DOC2BQ14184 412 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SSX1Q16384 188 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PGAP1Q75T13 922 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 RDH10Q8IZV5 341 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A40Q8TBP6 338 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SPSB4Q96A44 273 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TMED9Q9BVK6 235 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PLK3Q9H4B4 646 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 CMAHPQ9Y471 501 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GTI1 187 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GGT3PA6NGU5 568 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DHRS3O75911 302 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV3-1P01715 115 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 CCL1P22362 96 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 THBS4P35443 961 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PPOXP50336 477 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF92Q03936 586 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 EFNB3Q15768 340 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 MOGQ16653 247 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 Q499Y3 187 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 FTMTQ8N4E7 242 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SYNPRQ8TBG9 265 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PHYHIPQ92561 330 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM203Q969S6 136 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf35Q96D05 121 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 HAVCR1Q96D42 359 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 CMBLQ96DG6 245 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF442Q9H7R0 627 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SSR3Q9UNL2 185 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DHDHQ9UQ10 334 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PLCE1Q9P212 2302 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 LRP5LA4QPB2 252 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 C5orf63A6NC05 138 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF879B4DU55 563 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 OCM2P0CE71 109 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DAOP14920 347 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 THBS2P35442 1172 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GSK3AP49840 483 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 FAM3AP98173 230 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZSR3 168 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 YIPF6Q96EC8 236 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 LYZL4Q96KX0 146 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 SOX7Q9BT81 388 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GPR160Q9UJ42 338 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 STUB1Q9UNE7 303 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2B-208ENST00000511807 CD300LBA8K4G0 201 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2B-208ENST00000511807 ARL6IP5O75915 188 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF250P15622 560 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF20P17024 532 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2B-208ENST00000511807 TGFBR2P37173 567 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms