RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	APH1B	Q8WW43	257 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	LYZL4	Q96KX0	146 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.9	□□□□□ -0.18
MIB2-223	ENST00000508148	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		J3QRE1	110 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF12	P17014	697 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ACTA2	P62736	377 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ACTG2	P63267	376 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF85	Q03923	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RAB40B	Q12829	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS12	Q96DT0	336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	GNG8	Q9UK08	70 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		A8MXK9	166 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		H0YAE9	185 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FOXH1	O75593	365 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CLIC3	O95833	236 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TTR	P02766	147 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	HKR1	P10072	659 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IRF2	P14316	349 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ACKR3	P25106	362 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CAPG	P40121	348 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MAP2K3	P46734	347 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	BTG1	P62324	171 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF154	Q13106	437 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	DOK3	Q7L591	496 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		Q8TCH9	128 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	DHRS3	O75911	302 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CST4	P01036	141 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ISL1	P61371	349 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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