RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR4K17Q8NGC6 315 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR5B3Q8NH48 314 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 PIGTQ969N2 578 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 THYN1Q9P016 225 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ODAMA1E959 279 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 M0R129 80 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RFXANKO14593 260 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RAMP1O60894 148 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 CEACAM4O75871 244 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 DIRAS1O95057 198 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 DDAH2O95865 285 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 LAMP2P13473 410 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 EPCAMP16422 314 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 AMTP48728 403 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RUNX1Q01196 453 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 DUSP5Q16690 384 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZRG5 221 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SCD5Q86SK9 330 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 LAS2Q8IYD9 372 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLC5A8Q8N695 610 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GATSQ8NAP1 163 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 NPEPL1Q8NDH3 523 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 PSMF1Q92530 271 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RAB8BQ92930 207 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GPR82Q96P67 336 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 MCEEQ96PE7 176 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GPA33Q99795 319 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ASCL2Q99929 193 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RHOJQ9H4E5 214 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ERG28Q9UKR5 140 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SHISA3A0PJX4 238 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SAT1P21673 171 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RND2P52198 227 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 UCP2P55851 309 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 WNT3AP56704 352 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RAB10P61026 200 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 RAB32Q13637 225 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SCARF1Q14162 830 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 HIST3H3Q16695 136 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TP53I3Q53FA7 332 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 CPTPQ5TA50 214 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 NIPAL3Q6P499 406 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF709Q8N972 641 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR2T33Q8NG76 320 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TRIB3Q96RU7 358 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLC17A9Q9BYT1 436 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TNS2Q63HR2 1409 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SHANK3Q9BYB0 1731 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GTI1 187 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PR80 420 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ZAR1LA6NP61 321 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 YPEL1O60688 119 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 PMS2P2O95744 297 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GPANK1O95872 356 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 IGLC1P0CG04 106 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 HTR1FP30939 366 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 GALNT16Q8N428 558 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 OR4D11Q8NGI4 311 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-216ENST00000507116 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms