RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 C8orf4Q9NR00 106 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 R4GMQ9 66 aa7.36□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 A0A1B0GTI1 187 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 METTL15A6NJ78 407 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 B4DSR2 109 aa7.35□□□□□ -1.23
ITGB1-217ENST00000494395 MPZL2O60487 215 aa7.35□□□□□ -1.23
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ITGB1-217ENST00000494395 ZNF205O95201 554 aa7.35□□□□□ -1.23
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ITGB1-217ENST00000494395 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.34□□□□□ -1.23
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ITGB1-217ENST00000494395 DHRS3O75911 302 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 LHBP01229 141 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 THBS2P35442 1172 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 CSNK2BP67870 215 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 ACTC1P68032 377 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 ACTA1P68133 377 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 PRDX4Q13162 271 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 GALEQ14376 348 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 SNCBQ16143 134 aa7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 CR1LQ2VPA4 569 aa7.33□□□□□ -1.24
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