RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR4S2Q8NH73 311 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NTAN1Q96AB6 310 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HAUS1Q96CS2 278 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 Q96MT0 163 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RNF145Q96MT1 663 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 COA1Q9GZY4 146 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ARV1Q9H2C2 271 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 WDR54Q9H977 334 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ADCY9O60503 1353 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ELP1O95163 1332 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ABCB11O95342 1321 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TTC37Q6PGP7 1564 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IQSEC2Q5JU85 1478 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PEX7O00628 323 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IGLV1-47P01700 117 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 P01737 135 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RAB3AP20336 220 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GGT2P36268 569 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CDKN2BP42772 138 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MAGEA2P43356 314 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GALR1P47211 349 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 UBE2E1P51965 193 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 EMP2P54851 167 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR12D2P58182 307 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RAB31Q13636 194 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GPNMBQ14956 572 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PON3Q15166 354 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GUSBP1Q15486 140 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 METTL13Q8N6R0 699 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NPWQ8N729 165 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DNAJB3Q8WWF6 145 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RORBQ92753 470 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NAGKQ9UJ70 344 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ALKQ9UM73 1620 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NFASCO94856 1347 aa3.44□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GUA9 196 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SLC5A10A0PJK1 596 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 M0R1B8 84 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MYL12BO14950 172 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CTNSO60931 367 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ATP5HO75947 161 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GLSO94925 669 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 BRI3O95415 125 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PSMG1O95456 288 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RAB36O95755 333 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 BGLAPP02818 100 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OCM2P0CE71 109 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 THRAP10827 490 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ELK1P19419 428 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TALDO1P37837 337 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CYB561P49447 251 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MNAT1P51948 309 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.862e-10■■■□□ 18.9
CCL20-204ENST00000489160 WNT4P56705 351 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R46P59540 309 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RHOAP61586 193 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IL5RAQ01344 420 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GINS1Q14691 196 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CASP8Q14790 479 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IL17AQ16552 155 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 GUCA2BQ16661 112 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 EXOC3L4Q17RC7 722 aa3.43□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms