RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477237.1

XRN1-211, Transcript of 5'-3' exoribonuclease 1, humanhuman

TSL 5

Gene XRN1, Length 686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN1-211ENST00000477237 RORCP51449 518 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CTSCP53634 463 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 TMEM50BP56557 158 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CLDN12P56749 244 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR10A3P58181 314 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CKS1BP61024 79 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 PPP3R1P63098 170 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 GNG3P63215 75 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 KLRC3Q07444 240 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ST3GAL3Q11203 375 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 HSPB3Q12988 150 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 GPR17Q13304 367 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 MFAP5Q13361 173 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ZNF846Q147U1 533 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 TSNQ15631 228 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ZNF77Q15935 545 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 TAF9Q16594 264 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ISXQ2M1V0 245 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ODF4Q2M2E3 257 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SPIN4Q56A73 249 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 NCMAPQ5T1S8 102 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 AVPI1Q5T686 147 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ANKRD22Q5VYY1 191 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ENPP7Q6UWV6 458 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR2W3Q7Z3T1 314 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CPNE9Q8IYJ1 553 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ZNF676Q8N7Q3 588 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ACOT4Q8N9L9 421 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 KIAA0895Q8NCT3 520 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR56A4Q8NGH8 313 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR51S1Q8NGJ8 323 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR2AE1Q8NHA4 323 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR5K1Q8NHB7 308 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 BAALCQ8WXS3 180 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ISOC2Q96AB3 205 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CMBLQ96DG6 245 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 PELI1Q96FA3 418 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 HSFY1Q96LI6 401 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SGK494Q96LW2 274 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 LINC00052Q96N35 136 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 LINC00167Q96N53 147 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OR7D2Q96RA2 312 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 IL4I1Q96RQ9 567 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SORT1Q99523 831 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SEPHS2Q99611 448 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 C20orf144Q9BQM9 153 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 DPH7Q9BTV6 452 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 OSBPL11Q9BXB4 747 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CDCA4Q9BXL8 241 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 REG4Q9BYZ8 158 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 DSN1Q9H410 356 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 FAM96AQ9H5X1 160 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 REEP4Q9H6H4 257 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 PTGES2Q9H7Z7 377 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 AMBNQ9NP70 447 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ISYNA1Q9NPH2 558 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 INPP5EQ9NRR6 644 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 PLSCR3Q9NRY6 295 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 LGALS13Q9UHV8 139 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 FBXO5Q9UKT4 447 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ING4Q9UNL4 249 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 RNF6Q9Y252 685 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 V9GYY9 64 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ASTN1O14525 1302 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 ABCB11O95342 1321 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 IQSEC2Q5JU85 1478 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 A0A096LPI6 279 aa2.04□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.04□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 CIB4A0PJX0 185 aa2.04□□□□□ -2.08
XRN1-211ENST00000477237 LAMB4A4D0S4 1761 aa2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms