RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 XRCC2O43543 280 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 RHBDL1O75783 438 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V1B2P21281 511 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 POU1F1P28069 291 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 HSD11B1P28845 292 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GRK5P34947 590 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 IFNGR2P38484 337 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 PRDX4Q13162 271 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 FAM189A2Q15884 450 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 PLA1AQ53H76 456 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 PGAM5Q96HS1 289 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 LYZL4Q96KX0 146 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CDRT15Q96T59 188 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CD300AQ9UGN4 299 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.14□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 NDUFAB1O14561 156 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ANGPTL7O43827 346 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CHST1O43916 411 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 TGFBR2P37173 567 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GNALP38405 381 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 DDOSTP39656 456 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GABRA2P47869 451 aa9.13□□□□□ -0.95
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ACTB-209ENST00000473257 EFNB2P52799 333 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 MXRA7P84157 204 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 MZT1Q08AG7 82 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 HERPUD1Q15011 391 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 BATF2Q8N1L9 274 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 PIGCQ92535 297 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ZNF488Q96MN9 340 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 SSX3Q99909 188 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 MICU1Q9BPX6 476 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 IL20Q9NYY1 176 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 U3KQV3 271 aa9.13□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 SELENOFO60613 162 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CCNB2O95067 398 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 HSD17B1P14061 328 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 COX7A1P24310 79 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GSTT1P30711 240 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 OPRL1P41146 370 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GPM6AP51674 278 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 UBE2E1P51965 193 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A1P53007 311 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 HCCSP53701 268 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GUCA2AQ02747 115 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 FBLN7Q53RD9 439 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 CEP78Q5JTW2 689 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 TEX30Q5JUR7 227 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZTK2 550 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 MKXQ8IYA7 352 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 RNF170Q96K19 258 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 INTS14Q96SY0 518 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 OR10A2Q9H208 303 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.12□□□□□ -0.95
ACTB-209ENST00000473257 OPA3Q9H6K4 179 aa9.12□□□□□ -0.95
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