RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 CYP51A1Q16850 503 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 VMACQ2NL98 169 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 NRN1LQ496H8 165 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 EIPR1Q53HC9 387 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 EMC4Q5J8M3 183 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 EPGNQ6UW88 154 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.383e-6■□□□□ 9.6
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MDGA2Q7Z553 956 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 Q8N402 240 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM156Q8N614 296 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR7G2Q8NG99 324 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5R1Q8NH85 324 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR151Q8TDV0 419 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 GHSRQ92847 366 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OSTF1Q92882 214 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 VSTM2LQ96N03 204 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2M2Q96R28 347 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ALG12Q9BV10 488 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 FN3KQ9H479 309 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MSL2Q9HCI7 577 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.44□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PINLYPA6NC86 204 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CXorf65A6NEN9 183 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 A8MZ25 164 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TEX46H3BTG2 121 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 AP4M1O00189 453 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD28O15084 1053 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 HPGDSO60760 199 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 RAD51DO75771 328 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 LRATO95237 230 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CST4P01036 141 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CRYBA1P05813 215 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CCL3P10147 92 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 FCGR1AP12314 374 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 BMP4P12644 408 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 NID1P14543 1247 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 MAKP20794 623 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 SSTR5P35346 364 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PNLIPRP2P54317 469 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 DHODHQ02127 395 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 NNATQ16517 81 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TAF9Q16594 264 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PGGHGQ32M88 737 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 AGKQ53H12 422 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CGB2Q6NT52 195 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF774Q6NX45 483 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OPN5Q6U736 354 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 BAP18Q8IXM2 172 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2L13Q8N349 312 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4S2Q8NH73 311 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM45BQ96B21 275 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 PPCDCQ96CD2 204 aa6.43□□□□□ -1.38
RPUSD3-212ENST00000466141 NTNG2Q96CW9 530 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms