RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR51F2	Q8NH61	342 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RNF170	Q96K19	258 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ALG8	Q9BVK2	526 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ABCB9	Q9NP78	766 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	DNHD1	Q96M86	4753 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		H0YAE9	185 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-1	P01715	115 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	IL18R1	Q13478	541 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	WDR38	Q5JTN6	314 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CEP78	Q5JTW2	689 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	DOK3	Q7L591	496 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		Q8TCH9	128 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ITPKC	Q96DU7	683 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	C1orf159	Q96HA4	380 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	C4orf36	Q96KX1	117 aa		14.91	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		A6NIN4	97 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SYT7	O43581	403 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CRLF1	O75462	422 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	HTR1A	P08908	422 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	GNAO1	P09471	354 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CD80	P33681	288 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ISL1	P61371	349 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CSNK2B	P67870	215 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF154	Q13106	437 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	GALE	Q14376	348 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	WDR86	Q86TI4	376 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	NRG4	Q8WWG1	115 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ITFG2	Q969R8	447 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	BEX2	Q9BXY8	128 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	TMEM165	Q9HC07	324 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		14.9	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GTI1	187 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	C3orf80	F5H4A9	247 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	PLPP2	O43688	288 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	NRAS	P01111	189 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	IGHA1	P01876	353 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	THBS2	P35442	1172 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GPM6A	P51674	278 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LCN2	P80188	198 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMEM186	Q96B77	213 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902		V9GYS6	101 aa		14.89	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	IRGM	A1A4Y4	181 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	TMEM210	A6NLX4	147 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZNF732	B4DXR9	585 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CDIPT	O14735	213 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	HNF1A	P20823	631 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	KIR3DL2	P43630	455 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GMFB	P60983	142 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CR1L	Q2VPA4	569 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	RDH10	Q8IZV5	341 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	LRRC29	Q8WV35	223 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	PELI1	Q96FA3	418 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	VCX3B	Q9H321	246 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	GPR173	Q9NS66	373 aa		14.88	□□□□□ -0.03
USP19-210	ENST00000465902	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		14.88	□□□□□ -0.03

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