RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452779.2

CSAG1-204, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-204ENST00000452779 CAPGP40121 348 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ODF4Q2M2E3 257 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 CDONQ4KMG0 1287 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 MOB3CQ70IA8 216 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 CATSPERDQ86XM0 798 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 CCDC54Q8NEL0 328 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 RORBQ92753 470 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ITPKCQ96DU7 683 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 TMEM165Q9HC07 324 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 MIOXQ9UGB7 285 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 SLC22A13Q9Y226 551 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 H0YAE9 185 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 J3QLW9 94 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 J3QRE1 110 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 SYT7O43581 403 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 PLPP2O43688 288 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 CLIC3O95833 236 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 HTR1AP08908 422 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 FAHP16930 419 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF12P17014 697 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF19P17023 458 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 PSMB10P40306 273 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 GALEQ14376 348 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 CR1LQ2VPA4 569 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ESCO2Q56NI9 601 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 FAM120AOSQ5T036 256 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 APH1BQ8WW43 257 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 POM121Q96HA1 1249 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ALG8Q9BVK2 526 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-204ENST00000452779 NF1P21359 2839 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 A0A0G2JMP0 313 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 A0A0X1KG70 313 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 LGALS8O00214 317 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 NDUFA2O43678 99 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 NRASP01111 189 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR12D2P58182 307 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 ISL1P61371 349 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 GNG3P63215 75 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 LCN2P80188 198 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF154Q13106 437 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 MED21Q13503 144 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF404Q494X3 552 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 WDR38Q5JTN6 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 CEP78Q5JTW2 689 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 FAM201AQ5SY85 155 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 KRT74Q7RTS7 529 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 LRRC29Q8WV35 223 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 FAHD2AQ96GK7 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 C4orf36Q96KX1 117 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR8B2Q96RD0 313 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 VCX3BQ9H321 246 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 V9GYS6 101 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 A0A1B0GTI1 187 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OOEPA6NGQ2 149 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 OR5B21A6NL26 309 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF732B4DXR9 585 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 C3orf80F5H4A9 247 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 CDIPTO14735 213 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-204ENST00000452779 SERPINA3P01011 423 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms