RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 RAB40BQ12829 278 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 POU4F2Q12837 409 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SPRNQ5BIV9 151 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TEX30Q5JUR7 227 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 C16orf87Q6PH81 154 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 ZNF773Q6PK81 442 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 DRAM2Q6UX65 266 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZR03 302 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 OR10H4Q8NGA5 316 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TMEM80Q96HE8 168 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WXM4 84 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 GGT3PA6NGU5 568 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 HTR1AP08908 422 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 MYL12AP19105 171 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 HCCSP53701 268 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 BPIFB3P59826 476 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 PCK2Q16822 640 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 TIGD6Q17RP2 521 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 FAM57BQ71RH2 274 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SLC16A9Q7RTY1 509 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-210ENST00000442481 OR8G5Q8NG78 346 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 OR2V2Q96R30 315 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 SLC30A2Q9BRI3 323 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 MMP27Q9H306 513 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 MMP26Q9NRE1 261 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-210ENST00000442481 DAPL1A0PJW8 107 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 C5orf63A6NC05 138 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 H0YL77 283 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PSMD9O00233 223 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 IGHA1P01876 353 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DPB1P04440 258 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ANOS1P23352 680 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 DCKP27707 260 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MAP2K4P45985 399 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ACTC1P68032 377 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ACTA1P68133 377 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF92Q03936 586 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PDCD1Q15116 288 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 KRT77Q7Z794 578 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 SPARTQ8N0X7 666 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 SVOPQ8N4V2 548 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OTOSQ8NHW6 89 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PGAM5Q96HS1 289 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MARCH7Q9H992 704 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 TMEM100Q9NV29 134 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 IL19Q9UHD0 177 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 SCOCQ9UIL1 159 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 COPS3Q9UNS2 423 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 F5H5P2 479 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC2LH3BP13 241 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MYL12BO14950 172 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 XRCC2O43543 280 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 OR2T7P0C7T2 308 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-210ENST00000442481 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
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