RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 PRRG2O14669 202 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 LDLRAD4O15165 306 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CTAG2O75638 210 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 RAD51DO75771 328 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 LYZL6O75951 148 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ECDO95905 644 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 PRF1P14222 555 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV1-2P23083 117 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TIMP3P35625 211 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 EFNB2P52799 333 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R20P59543 309 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 AP3S2P59780 193 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 HGFACQ04756 655 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 RBPJQ06330 500 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 P2RY6Q15077 328 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 GABRA6Q16445 453 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB37Q5TC79 503 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 AWAT2Q6E213 333 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 RAB12Q6IQ22 244 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 KRT74Q7RTS7 529 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 MDP1Q86V88 176 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 LYPD6Q86Y78 171 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 OR2AE1Q8NHA4 323 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ENKURQ8TC29 256 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FAM46BQ96A09 425 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 SPSB4Q96A44 273 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 BOD1Q96IK1 185 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TECTBQ96PL2 329 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 SOX7Q9BT81 388 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CDH20Q9HBT6 801 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 KCNN3Q9UGI6 736 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 SLC7A11Q9UPY5 501 aa5.75□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 GGT3PA6NGU5 568 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 PLA2G10O15496 165 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 LYRM1O43325 122 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 GMDSO60547 372 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 NRASP01111 189 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CGAP01215 116 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CD3GP09693 182 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FAM87AP0C7U9 286 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 EDN3P14138 238 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 CBR1P16152 277 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 COX5AP20674 150 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ANOS1P23352 680 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 PRSS3P35030 304 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 GDNFP39905 211 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 PTGFRP43088 359 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 RFX2P48378 723 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 PTH2RP49190 550 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 BCAP31P51572 246 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FUT6P51993 359 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ATP1B3P54709 279 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 MTCP1P56278 107 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 DGCR2P98153 550 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FAM3AP98173 230 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF92Q03936 586 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 PMPCAQ10713 525 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FOXF2Q12947 444 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 DYRK1AQ13627 763 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 OR8B8Q15620 311 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 KISS1Q15726 138 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 UBE2V2Q15819 145 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 VWA1Q6PCB0 445 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 GFRALQ6UXV0 394 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 MOB3CQ70IA8 216 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 FTMTQ8N4E7 242 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.74□□□□□ -1.49
HDAC8-211ENST00000415409 Q8NA96 180 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms