RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 MPPED2Q15777 294 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CYB5R2Q6BCY4 276 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 LAIR2Q6ISS4 152 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 STX19Q8N4C7 294 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 KLHL36Q8N4N3 616 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 OR14K1Q8NGZ2 314 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 OR5P3Q8WZ94 311 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 DCAF16Q9NXF7 216 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa23.13■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 KIR3DL2P43630 455 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 ETV1P50549 477 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 BTG1P62324 171 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 C6orf141Q5SZD1 244 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CSPG4Q6UVK1 2322 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 Q6ZSR3 168 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CLDND2Q8NHS1 167 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 GAL3ST1Q99999 423 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 SCN3BQ9NY72 215 aa23.12■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM210A6NLX4 147 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 NRASP01111 189 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 ISG15P05161 165 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CLVS2Q5SYC1 327 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 KCTD8Q6ZWB6 473 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 AHSA2Q719I0 299 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 RNF170Q96K19 258 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 RNF7Q9UBF6 113 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 RAB26Q9ULW5 256 aa23.11■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CD5LO43866 347 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC159P0C7I6 412 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 MDH2P40926 338 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 PMELP40967 661 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 TGM4P49221 684 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CEACAM21Q3KPI0 293 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 SPICQ8N5J4 248 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF676Q8N7Q3 588 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 OR1M1Q8NGA1 313 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 C10orf35Q96D05 121 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 RAB39BQ96DA2 213 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 C1orf123Q9NWV4 160 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 MTORP42345 2549 aa23.1■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 WNT9BO14905 357 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 IGHV2-70P01814 119 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 IGHV4-31P0DP07 118 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 PLCXD3Q63HM9 321 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 MOB3CQ70IA8 216 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 RDH10Q8IZV5 341 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 OR5A2Q8NGI9 324 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 COMMD4Q9H0A8 199 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 HHLA2Q9UM44 414 aa23.09■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 OR5B21A6NL26 309 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM212A6NML5 194 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 FSTL3O95633 263 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 GNG3P63215 75 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF154Q13106 437 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC58Q4VC31 144 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM155Q4W5P6 130 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 CEP78Q5JTW2 689 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 OR52N1Q8NH53 320 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 MYDGFQ969H8 173 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 PCDHB10Q9UN67 800 aa23.08■■□□□ 1.29
FAAP20-204ENST00000400919 PPIAL4EA0A075B759 164 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 OR4C45A6NMZ5 311 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 PPIAL4DF5H284 164 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 H3BSH0 61 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 SLC1A7O00341 560 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 SERPINA3P01011 423 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 PPIAL4FP0DN26 164 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 IL2RGP31785 369 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 ZMYND11Q15326 602 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 OR2G6Q5TZ20 316 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM42Q69YG0 159 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 HPSE2Q8WWQ2 592 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 Q9H521 79 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF665Q9H7R5 613 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 BABAM2Q9NXR7 383 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 UBAP1Q9NZ09 502 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 CLEC2DQ9UHP7 191 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 TPRKBQ9Y3C4 175 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 PPIAL4AQ9Y536 164 aa23.08■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 DYSFO75923 2080 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 PTGES3LE9PB15 166 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 THBS2P35442 1172 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 GPM6AP51674 278 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 LMO4P61968 165 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 KRTAP1-1Q07627 177 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 FAM76BQ5HYJ3 339 aa23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FAAP20-204ENST00000400919 Q71RC1 249 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms