RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS12P56730 875 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF774Q6NX45 483 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 SPTBP11277 2137 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 H3BP45 60 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 APOA2P02652 100 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF32P17041 273 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 IL3RAP26951 378 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CD300CQ08708 224 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF321PQ8N8H1 164 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 LFNGQ8NES3 379 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 EXTL1Q92935 676 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 GNG13Q9P2W3 67 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PR80 420 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CNIH1O95406 144 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFA4P12838 97 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 FUT3P21217 361 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 DRAM2Q6UX65 266 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 S100A7AQ86SG5 101 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CKAP5Q14008 2032 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MKRN2OSH3BPM6 223 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MT-CO3P00414 261 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 SEMG1P04279 462 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4D9Q8NGE8 314 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 POU2F2P09086 479 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB4AP20338 218 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 GZMMP51124 257 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 FXNQ16595 210 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ST3GAL2Q16842 350 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ST8SIA2Q92186 375 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 SPSB1Q96BD6 273 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 KPTNQ9Y664 436 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 HLA-HP01893 362 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52N4Q8NGI2 321 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 HSBP1L1C9JCN9 74 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB5CP51148 216 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA1AQ53H76 456 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 GPA33Q99795 319 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 R4GN57 208 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5H15A6NDH6 313 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CTAG2O75638 210 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MT-ND4LP03901 98 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 IL5P05113 134 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC25A32Q9H2D1 315 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MTCH2Q9Y6C9 303 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP7O14520 342 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MGST1P10620 155 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PTGFRP43088 359 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 SPEM2Q0P670 501 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB35Q15286 201 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10D3Q8NH80 312 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CMTM3Q96MX0 182 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNIP2Q9NS61 270 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 MED9Q9NWA0 146 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CCL4P13236 92 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 THBS3P49746 956 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 FUT7Q11130 342 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 GSG1Q2KHT4 349 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2T2Q6IF00 324 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 BOD1Q96IK1 185 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 SCO1O75880 301 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CD96P40200 585 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 NDUFA6P56556 154 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 CARFQ8N187 725 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 DLL4Q9NR61 685 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-202ENST00000392011 TNFSF14O43557 240 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms