RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUBA4BQ9H853 241 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACOT9Q9Y305 439 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 MROH5Q6ZUA9 1318 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 C19orf71A6NCJ1 209 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMCO2A6NFE2 343 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0R3G1 203 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSPHP1O15172 72 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 GUCA1CO95843 209 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 CGB3P0DN86 165 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRSS3P35030 304 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFNAR2P48551 515 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 FABP6P51161 128 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRDX4Q13162 271 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SS18Q15532 418 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 HHATQ5VTY9 493 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM236Q5W0B7 351 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 REEP3Q6NUK4 255 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZYG11AQ6WRX3 759 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 C3orf22Q8N5N4 141 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q8NAQ8 132 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR4K13Q8NH42 304 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAD51AP1Q96B01 352 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SGTBQ96EQ0 304 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIB3Q96RU7 358 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTTY12Q9BZ98 90 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 RDH14Q9HBH5 336 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ICOSQ9Y6W8 199 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 MUC5ACP98088 5654 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 OTOFQ9HC10 1997 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 H7C0C1 242 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLOCKO15516 846 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC16A7O60669 478 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF24P17028 368 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFHR2P36980 270 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP5OP48047 213 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERFP50548 548 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB10P61026 200 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAPRE2Q15555 327 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 C22orf42Q6IC83 251 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q6ZQT7 251 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC16A14Q7RTX9 510 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 HORMAD1Q86X24 394 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFXN5Q8TD22 340 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 NT5C3BQ969T7 300 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 CYP3A43Q9HB55 503 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM165Q9HC07 324 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PISDQ9UG56 409 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADGRB3O60242 1522 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF860A6NHJ4 632 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 AP3B1O00203 1094 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 RRM2P31350 389 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRDNQ13061 729 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 DHRS2Q13268 280 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R7Q15435 360 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 HADHQ16836 314 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 KDM4DQ6B0I6 523 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC8B1Q6J4K2 584 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR7G2Q8NG99 324 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 LYPD6BQ8NI32 183 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 BLNKQ8WV28 456 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPEQ96AT9 228 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNF8Q96H20 258 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALS2CR12Q96Q35 445 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 DERL3Q96Q80 235 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC40Q9H9A6 602 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 HYPKQ9NX55 129 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 NME4O00746 187 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDC80O14777 642 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2J3O76001 311 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 LSM8O95777 96 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 HBE1P02100 147 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC2A3P11169 496 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 TEAD1P28347 426 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB7AP51149 207 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 SELENBP1Q13228 472 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC23LQ6PF05 361 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2J2Q8N2K1 259 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR10D4PQ8NGN7 298 aa0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms