RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 OR2W3Q7Z3T1 314 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 UMAD1C9J7I0 102 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF1AP19438 455 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SSTP61278 116 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA46Q5T0L3 261 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PSENENQ9NZ42 101 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SMCHD1A6NHR9 2005 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GPR31O00270 319 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 IAPPP10997 89 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 DEFA6Q01524 100 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GUCA2AQ02747 115 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ST8SIA4Q92187 359 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MAGT1Q9H0U3 335 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO34Q9NWN3 711 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SCN1AP35498 2009 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OR5G3P0C626 314 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GNB1P62873 340 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF766Q5HY98 468 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDD2Q6NTF9 364 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM123Q8N131 208 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MED30Q96HR3 178 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OCEL1Q9H607 264 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GNB4Q9HAV0 340 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FAM60AQ9NP50 221 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 DOCK2Q92608 1830 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 KLK10O43240 276 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A6Q8IZM9 456 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF485Q8NCK3 441 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 OR8U1Q8NH10 309 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SOX7Q9BT81 388 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 RER1O15258 196 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GPM6AP51674 278 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 SSPNQ14714 243 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 GP1BAP07359 652 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TGM1P22735 817 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 KISS1Q15726 138 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 PXDC1Q5TGL8 231 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 WDFY2Q96P53 400 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 MTCH1Q9NZJ7 389 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-203ENST00000366687 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ADRB1P08588 477 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBB2P43320 205 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 GFRALQ6UXV0 394 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS3O75911 302 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SCAND1P57086 179 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 UBE3DQ7Z6J8 389 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CBLN3Q6UW01 205 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 DBX2Q6ZNG2 339 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TCTE3Q8IZS6 198 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRL4Q9HBW9 690 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FZD5Q13467 585 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 THSD4Q6ZMP0 1018 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 HGDQ93099 445 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR2C1O95371 312 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 METTL15P1P0C7V9 234 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 SRD5A2P31213 254 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PHYHD1Q5SRE7 291 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR4F5Q8NH21 305 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR4F4Q96R69 305 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 DOK1Q99704 481 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR7C2O60412 319 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 NMES1Q9C002 83 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 DVL1O14640 695 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 CT62P0C5K7 136 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 GLCCI1Q86VQ1 547 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 FAM58AQ8N1B3 248 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-203ENST00000366687 ST8SIA2Q92186 375 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms