RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365359.1

RNU6-1138P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1138, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1138P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TICAM2Q86XR7 235 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UBAC2Q8NBM4 344 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR2V1Q8NHB1 315 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CAPSLQ8WWF8 208 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC41A3Q96GZ6 507 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 STARD10Q9Y365 291 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AKNAQ7Z591 1439 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM72A0PK05 275 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 A8MWP4 228 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ISLRO14498 428 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AIM2O14862 343 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MAGEB3O15480 346 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 AQP8O94778 261 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CXorf1O96002 111 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CST1P01037 141 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GZMAP12544 262 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GABRG2P18507 467 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FOXN2P32314 431 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TUFMP49411 452 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CTSL3PQ5NE16 218 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MFSD14CQ5VZR4 134 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 REEP3Q6NUK4 255 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CPNE9Q8IYJ1 553 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BPIFCQ8NFQ6 507 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR10W1Q8NGF6 305 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 C10orf105Q8TEF2 133 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TUBGCP3Q96CW5 907 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SGTBQ96EQ0 304 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BTN2A3PQ96KV6 586 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ALS2CR12Q96Q35 445 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CXCL16Q9H2A7 254 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 VCX2Q9H322 139 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF160Q9HCG1 818 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NUP205Q92621 2012 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CRB1P82279 1406 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 A0A0G2JMP0 313 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 A0A0X1KG70 313 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ERICH4A6NGS2 130 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PCP4L1A6NKN8 68 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 KNCNA6PVL3 124 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NME4O00746 187 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ANGPT2O15123 496 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MTX2O75431 263 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NAPSAO96009 420 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MCF2P10911 925 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PFN2P35080 140 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PCK1P35558 622 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 G6PCP35575 357 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CTAG1AP78358 180 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TRAM2Q15035 370 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CST6Q15828 149 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ATAD3BQ5T9A4 648 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 NOXRED1Q6NXP6 359 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 Q6ZQT7 251 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CMC1Q7Z7K0 106 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SPATA4Q8NEY3 305 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR8K1Q8NGG5 319 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 FAM57AQ8TBR7 257 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 RDH12Q96NR8 316 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 TMEM38AQ9H6F2 299 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 METTL7AQ9H8H3 244 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 U3KQK5 164 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 ROS1P08922 2347 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 PXDNLA1KZ92 1463 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 USP47Q96K76 1375 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 H3BMM0 161 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 GMFGO60234 142 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 SLC16A7O60669 478 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 HPRT1P00492 218 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 OXTP01178 125 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1138P-201ENST00000365359 MYL9P24844 172 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms