RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM104Q8NE00 496 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4M2Q8NGB6 313 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1S1Q8NH92 325 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFXN5Q8TD22 340 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIH1D2Q8WWB5 315 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 RXFP2Q8WXD0 754 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX13Q92968 403 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAT6Q93015 286 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 C18orf15Q96N68 181 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFXN3Q9BWM7 321 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 BLZF1Q9H2G9 400 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TREX1Q9NSU2 369 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSME2Q9UL46 239 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIGLEC7Q9Y286 467 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR51B2Q9Y5P1 312 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC41PQ6P2S7 1318 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa1.4□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPXA8MT69 81 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HACD1B0YJ81 288 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BN98 237 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYL12BO14950 172 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSPHP1O15172 72 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR7C2O60412 319 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 UPK1BO75841 260 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCA5LO95447 670 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC4O95801 387 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLK1P06870 262 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD28P10747 220 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXCR1P25024 350 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS3P35030 304 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAOAP59103 153 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1CAP62136 330 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBX1P62877 108 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG1Q07617 926 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 INCA1Q0VD86 236 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSC22D1Q15714 1073 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 STEAP4Q687X5 459 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK40Q8N2I9 435 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A29Q8N8R3 303 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR31Q8NA23 367 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1P1Q8NH06 330 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 S100PBPQ96BU1 408 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM19A4Q96LR4 140 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALS2CR12Q96Q35 445 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM175Q9BSA9 504 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANP32EQ9BTT0 268 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL22Q9GZX6 179 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRSS16Q9NQE7 514 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO8Q9NRD0 319 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEBP1Q9NRV9 189 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CES1P1Q9UKY3 287 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 SHROOM3Q8TF72 1996 aa1.39□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0B4J2E0 115 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ISPDA4D126 451 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 C16orf90A8MZG2 172 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01619G3V211 115 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 DFFAO00273 331 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFNGO00587 321 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNMDO75829 334 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCGP01275 180 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV2-8P01709 118 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAS1P04201 325 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV4-1P06312 121 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 NELFEP18615 380 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUBG1P23258 451 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL2P36404 184 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAP31P51572 246 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R39P59534 338 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAFAH1B2P68402 229 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCN2P80188 198 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADIGQ0VDE8 80 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL15RAQ13261 267 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL40Q2TBA0 621 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 KDM4DQ6B0I6 523 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00336Q6ZUF6 198 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ORMDL3Q8N138 153 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf64Q8NEQ6 169 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52N1Q8NH53 320 aa1.38□□□□□ -2.19
RNU6-78P-201ENST00000362897 ING5Q8WYH8 240 aa1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms