RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAR1BQ9Y6B6 198 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITGB4P16144 1822 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A075B6Q4 140 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSPHP1O15172 72 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CACNG3O60359 315 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV1-46P01743 117 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 THRAP10827 490 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CXCR1P25024 350 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL3RAP26951 378 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPIP34949 423 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGFBR2P37173 567 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 AP1S2P56377 157 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2B8PP59922 312 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1CAP62136 330 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BEX3Q00994 111 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDSRQ06136 332 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BIKQ13323 160 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TFDP2Q14188 446 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 RCN1Q15293 331 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC9A3R2Q15599 337 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR1Q1Q15612 314 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM104BQ5XKR9 115 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T5Q6IEZ7 315 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00336Q6ZUF6 198 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SSX9Q7RTT3 188 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 UNC93AQ86WB7 457 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BBS5Q8N3I7 341 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2T29Q8NH02 315 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASZ1Q8WWH4 475 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM159Q96B96 161 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BPIFA3Q9BQP9 254 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 AGMATQ9BSE5 352 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO8Q9NRD0 319 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 HEBP1Q9NRV9 189 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TREX1Q9NSU2 369 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBED9Q6R2W3 1325 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTAGE15A4D2H0 777 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 C17orf51A8MQB3 221 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC01619G3V211 115 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEDDO75618 318 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHG2P01859 326 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT16P08779 473 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TACSTD2P09758 323 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSTM3P21266 225 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACOT2P49753 483 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC74AQ0VAA2 488 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 INCA1Q0VD86 236 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 GABRA6Q16445 453 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 HADHQ16836 314 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPEL1Q2QD12 228 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PYDC2Q56P42 97 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 STEAP4Q687X5 459 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTAGE6Q86UF2 777 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 APRG1Q8IVJ8 170 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 C8orf31Q8N9H6 132 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC148Q8NFR7 591 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4C13Q8NGP0 309 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 RXFP2Q8WXD0 754 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALS2CR12Q96Q35 445 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELOVL6Q9H5J4 265 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASF1BQ9NVP2 202 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRCT1Q9UGL9 99 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB22AQ9UL26 194 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf16Q68DN1 1984 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM72A0PK05 275 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IZUMO1RA6ND01 250 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRASP01111 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 HRASP01112 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRASP01116 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5AC1P0C628 307 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 GZMMP51124 257 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR12D2P58182 307 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IRF8Q02556 426 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 HHATQ5VTY9 493 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDPNQ86YL7 162 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OFCC1Q8IZS5 231 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITFG1Q8TB96 612 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFXN5Q8TD22 340 aa0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.6 ms