RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC29Q8WV35 223 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGCQ92535 297 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTPD6O75354 484 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT8P05787 483 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T7P0C7T2 308 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1B1P15313 513 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHA1P21709 976 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF684Q5T5D7 378 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF841Q6ZN19 808 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A1Q86YD7 464 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T27Q8NH04 317 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM158Q8WZ71 300 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITFG2Q969R8 447 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLN8Q9UBY8 286 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM210A6NLX4 147 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDIPTO14735 213 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF21O43680 179 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS3O75911 302 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAHP16930 419 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF85Q03923 595 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ8Q15842 424 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHC2Q8IXK0 858 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX5Q9Y5X3 404 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GTI1 187 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRB1P18505 474 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1E1P36543 226 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTNR1AP48039 350 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCGB2A2Q13296 93 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCLNQ16625 522 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB37Q5TC79 503 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 NANPQ8TBE9 248 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNFT2Q96EX2 444 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF170Q96K19 258 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OCEL1Q9H607 264 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 AASSQ9UDR5 926 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGLQ9Y2B2 252 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 AUP1Q9Y679 476 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL15A6NJ78 407 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRRM5B3KS81 715 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 C22orf46C9J442 243 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3QRE1 110 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RY10O00398 339 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM20O43506 726 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT1C4O75897 302 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAG2O95816 211 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GYPAP02724 150 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFHR2P36980 270 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPM6AP51674 278 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISL1P61371 349 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAX8Q06710 450 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP78Q5JTW2 689 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPNQ5VXI9 398 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATSPERDQ86XM0 798 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCCPDHQ8NBX0 429 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10Z1Q8NGY1 313 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 STMN2Q93045 179 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRI1Q9BV20 369 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A13Q9Y226 551 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 V9GYS6 101 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFA2O43678 99 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCN3O75636 299 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL1P22362 96 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPY4RP50391 375 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN26Q16670 478 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms