RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315480.8

USP20-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-201ENST00000315480 CSN1S1P47710 185 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 POU4F3Q15319 338 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OTPQ5XKR4 325 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 RNF24Q9Y225 148 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 hADV38S2A0JD32 116 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PDGFAP04085 211 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SKP2Q13309 424 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SSX9Q7RTT3 188 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 EXTL1Q92935 676 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 TAAR6Q96RI8 345 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.61□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PPP3CBP16298 524 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 BTG1P62324 171 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OR10K2Q6IF99 312 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 MOB3BQ86TA1 216 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 GPX8Q8TED1 209 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 AP1S3Q96PC3 154 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 GINS3Q9BRX5 216 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ANGPTL7O43827 346 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CA6P23280 308 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SCGB2A2Q13296 93 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 RPEQ96AT9 228 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 BTF3L4Q96K17 158 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 C4orf45Q96LM5 186 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 C10orf90Q96M02 699 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 HRH4Q9H3N8 390 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 AKAP6Q13023 2319 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 NGFP01138 241 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PCMT1P22061 227 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 KCNJ3P48549 501 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 DHODHQ02127 395 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 A0A0B4J2A0 478 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 LIPT2A6NK58 231 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ZNF883P0CG24 379 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CDK5Q00535 292 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CD300CQ08708 224 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 NAA40Q86UY6 237 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 LSMEM1Q8N8F7 131 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 NTMQ9P121 344 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CACNA1HO95180 2353 aa11.6□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 FABP5Q01469 135 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 BTN1A1Q13410 526 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 HPNP05981 417 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 GLI4P10075 376 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 LIFP15018 202 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CCR6P51684 374 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OR6C68A6NDL8 312 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 GREM1O60565 184 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PRDX4Q13162 271 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CD226Q15762 336 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 PTP4A1Q93096 173 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.59□□□□□ -0.55
USP20-201ENST00000315480 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms