RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF850A8MQ14 1090 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 HPGDSO60760 199 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAND1P57086 179 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS23P62266 143 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SSC4DQ8WTU2 575 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GPER1Q99527 375 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 MIXL1Q9H2W2 232 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTD2Q9H8S5 307 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 HMG20AQ9NP66 347 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 AKIP1Q9NQ31 210 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC7A11Q9UPY5 501 aa17.79■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
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PACSIN3-201ENST00000298838 BMP4P12644 408 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GCH1P30793 250 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF8P32971 234 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GLRXP35754 106 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 MPV17P39210 176 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 BSPH1Q075Z2 132 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PSG7Q13046 419 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDX4Q13162 271 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RIN1Q13671 783 aa17.78■□□□□ 0.44
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PACSIN3-201ENST00000298838 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 MOB3CQ70IA8 216 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
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PACSIN3-201ENST00000298838 GPR160Q9UJ42 338 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ETV7Q9Y603 341 aa17.78■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 DPRXA6NFQ7 191 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBAL3A6NHL2 446 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 IQCF6A8MYZ5 107 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 CLDN25C9JDP6 229 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCD4O14678 606 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 P2RY14Q15391 338 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC25A28Q96A46 364 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM3DQ96BQ1 224 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 BORCS8Q96FH0 119 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 MPC1Q9Y5U8 109 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 HCFC1P51610 2035 aa17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PEX19P40855 299 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 RANBP1P43487 201 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPZA1P52907 286 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC22A25Q6T423 547 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC190Q86UF4 302 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 OR51D1Q8NGF3 324 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 OR4D6Q8NGJ1 314 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01560Q8TB33 94 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CRIM1Q9NZV1 1036 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 OR5V1Q9UGF6 321 aa17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 LILRA1O75019 489 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ARSBP15848 533 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ETV6P41212 452 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 POU3F4P49335 361 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 RBP2P50120 134 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FABP6P51161 128 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FUT6P51993 359 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 MTCP1P56278 107 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 AWAT2Q6E213 333 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP37Q8NFH4 326 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CMTM3Q96MX0 182 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CXorf56Q9H5V9 222 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF462Q96JM2 2506 aa17.76■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 APOA1P02647 267 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 KITLGP21583 273 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2NLQ5JXB2 153 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF144BQ7Z419 303 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD4AQ8N468 514 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FZR1Q9UM11 496 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM25AB3EWG3 89 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM25CB3EWG5 89 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM25GB3EWG6 89 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ELK1P19419 428 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 OR3A4PP47883 348 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF45Q02386 682 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF846Q147U1 533 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 CEACAM21Q3KPI0 293 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf76Q3KRA6 126 aa17.75■□□□□ 0.43
PACSIN3-201ENST00000298838 VHLLQ6RSH7 139 aa17.75■□□□□ 0.43
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