RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.59■□□□□ 0.89
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTDSPLO15194 276 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM157BP0CG42 384 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HTR2CP28335 458 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF92Q03936 586 aa20.58■□□□□ 0.89
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HACD4Q5VWC8 232 aa20.58■□□□□ 0.89
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa20.57■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52H1Q8NGJ2 320 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.57■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POU3F4P49335 361 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERVS71-1P61550 626 aa20.57■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH20Q9HBT6 801 aa20.57■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNK1Q13470 666 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 Q6ZSR3 168 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WFDC8Q8IUA0 241 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTTG3PQ9NZH4 202 aa20.56■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LANCL1O43813 399 aa20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF35P13682 527 aa20.55■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF462Q96JM2 2506 aa20.55■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR13C9Q8NGT0 318 aa20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LINC01560Q8TB33 94 aa20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.55■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.55■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNJ16Q9NPI9 418 aa20.55■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC2BP0DI82 140 aa20.54■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDK2P24941 298 aa20.54■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTH2RP49190 550 aa20.54■□□□□ 0.88
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DHRS3O75911 302 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARSBP15848 533 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGCR2P98153 550 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAAAQ02083 359 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD300CQ08708 224 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CBX3Q13185 183 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTFR2Q6P444 385 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDH26Q8IXH8 852 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52N4Q8NGI2 321 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMIM4Q8WVI0 70 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HCFC1P51610 2035 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAHP16930 419 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM3AP98173 230 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C10orf35Q96D05 121 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRIM1Q9NZV1 1036 aa20.53■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XRCC3O43542 346 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THBS4P35443 961 aa20.52■□□□□ 0.88
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFNB2P52799 333 aa20.52■□□□□ 0.88
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