RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD10Q9Y365 291 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 XRCC3O43542 346 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GMDSO60547 372 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 IL2RAP01589 272 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CD3GP09693 182 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 VSIG8P0DPA2 414 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 KISS1Q15726 138 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH26Q8IXH8 852 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN9O75954 239 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 HCKP08631 526 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MNDAP41218 407 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP2K3P46734 347 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R20P59543 309 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 RFT1Q96AA3 541 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR173Q9NS66 373 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TINAGQ9UJW2 476 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GGT3PA6NGU5 568 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BUI4 141 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PITPNAQ00169 270 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GFRALQ6UXV0 394 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGTQ969N2 578 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MEIOCA2RUB1 952 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 WIPF3A6NGB9 483 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 APLNRP35414 380 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PTX4Q96A99 478 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GAL3ST1Q99999 423 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV3-15P01624 115 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PP11 408 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRG2O14669 202 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TSC22D2O75157 780 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 AGFG2O95081 481 aa8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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RABGEF1-201ENST00000284957 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52I2Q8NH67 350 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ORC5O43913 435 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 NRASP01111 189 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB6AP20340 208 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGFRP43088 359 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 WBP1Q96G27 269 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC120Q96HB5 630 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51B6Q9H340 312 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 KLK11Q9UBX7 282 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA1BQ00975 2339 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 POLEQ07864 2286 aa8.05□□□□□ -1.12
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