RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DLL1O00548 723 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 XRCC2O43543 280 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CYTIPO60759 359 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NR2C1P13056 603 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 P2RY4P51582 365 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 STARD6P59095 220 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TAS2R31P59538 309 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RPS18P62269 152 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 IFI44Q8TCB0 444 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM100Q9NV29 134 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.64□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MEGF11A6BM72 1044 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 F8VVB4 439 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 F8VWA3 439 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TNFSF12O43508 249 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MPZL1O95297 269 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ERGP11308 486 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM33P57088 247 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 UBE2KP61086 200 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PLAURQ03405 335 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FHL1Q13642 323 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CDC20BQ86Y33 519 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OR5D18Q8NGL1 313 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TERB2Q8NHR7 220 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ASB5Q8WWX0 329 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MCHR2Q969V1 340 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OPA3Q9H6K4 179 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 WASF3Q9UPY6 502 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 IFNA21P01568 189 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 IGKV1D-16P01601 117 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RBP2P50120 134 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HMGN3Q15651 99 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 EXD3Q8N9H8 876 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C14orf144Q96I85 54 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 EHFQ9NZC4 300 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 A0A087WZY1 265 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CYB5BO43169 146 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TMEM127O75204 238 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ABHD16AO95870 558 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FOLR2P14207 255 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 YPEL5P62699 121 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HAGHQ16775 308 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MESTQ5EB52 335 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CBLN3Q6UW01 205 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 STACQ99469 402 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RNF122Q9H9V4 155 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.63□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SERINC4A6NH21 518 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 STMND1H3BQB6 276 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TCAPO15273 167 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HCRTR2O43614 444 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DIRAS3O95661 229 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CSTBP04080 98 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FOLR1P15328 257 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OR2T2Q6IF00 324 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.62□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OTOSQ8NHW6 89 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms