RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
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SYP-201ENST00000263233 MESP1Q9BRJ9 268 aa13.16□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa13.16□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OR10A2Q9H208 303 aa13.16□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ZNF576Q9H609 170 aa13.16□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 EHFQ9NZC4 300 aa13.16□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 VSTM2BA6NLU5 285 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 APOC1P02654 83 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SFTPBP07988 381 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FOLR1P15328 257 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 CD80P33681 288 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ID4P47928 161 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 CLRN1P58418 232 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 S100A12P80511 92 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 TMEM268Q5VZI3 342 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RNF122Q9H9V4 155 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RER1O15258 196 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FBXO24O75426 580 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 PGA4P0DJD7 388 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 PGA3P0DJD8 388 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ZNF708P17019 499 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 IGFBP4P22692 258 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 DHRS11Q6UWP2 260 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OR51T1Q8NGJ9 327 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ASH2LQ9UBL3 628 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 EXPH5Q8NEV8 1989 aa13.15□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 CCL1P22362 96 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 PTGER4P35408 488 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 PTGFRP43088 359 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 F2RL1P55085 397 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 OR1D5P58170 312 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 TAS2R46P59540 309 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 GABREP78334 506 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 MYBPHQ13203 477 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 ETV3LQ6ZN32 361 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 C1QL2Q7Z5L3 287 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 OR5D18Q8NGL1 313 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.14□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 PARP11Q9NR21 331 aa13.14□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 PRSS44E7EML9 344 aa13.14□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 CARD17Q5XLA6 110 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 FAM57BQ71RH2 274 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 UEVLDQ8IX04 471 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 PLPP5Q8NEB5 264 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 MEMO1Q9Y316 297 aa13.14□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GX78 115 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 E9PLN8 166 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 LINC01387J3KSC0 135 aa13.13□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 HPNP05981 417 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 RPL12P30050 165 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 C14orf28Q4W4Y0 310 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 FAM76BQ5HYJ3 339 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 Q6ZRG5 221 aa13.13□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.13□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 KIRREL1Q96J84 757 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 OR5B2Q96R09 309 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 PECRQ9BY49 303 aa13.13□□□□□ -0.31
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SYP-201ENST00000263233 C5orf63A6NC05 138 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 IGHG1P01857 330 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 ADH6P28332 368 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 ACY1Q03154 408 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 SWI5Q1ZZU3 235 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.13□□□□□ -0.31
SYP-201ENST00000263233 FBXL17Q9UF56 701 aa13.13□□□□□ -0.31
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