RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GGT3P	A6NGU5	568 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	NCR1	O76036	304 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RAC2	P15153	192 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DDOST	P39656	456 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CAV3	P56539	151 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR10A3	P58181	314 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF529	Q6P280	563 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR5AS1	Q8N127	324 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TPK1	Q9H3S4	243 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CA10	Q9NS85	328 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CASK	O14936	926 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CLDN1	O95832	211 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MAS1	P04201	325 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CD3E	P07766	207 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF250	P15622	560 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MTNR1B	P49286	362 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	UBE2V2	Q15819	145 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CEP78	Q5JTW2	689 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM42	Q69YG0	159 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	USP43	Q70EL4	1123 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	THRSP	Q92748	146 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CHST5	Q9GZS9	411 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TUBG1	P23258	451 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PEX19	P40855	299 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF144B	Q7Z419	303 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	C10orf35	Q96D05	121 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR173	Q9NS66	373 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GPR160	Q9UJ42	338 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CENPE	Q02224	2701 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A0G2JK05	382 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PRSS44	E7EML9	344 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		E7EQL1	145 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GMDS	O60547	372 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MYL9	P24844	172 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	KRT74	Q7RTS7	529 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM222B	Q8WU58	562 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PP6455	Q8WZ26	134 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SYT3	Q9BQG1	590 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	IL1A	P01583	271 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	KITLG	P21583	273 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GCH1	P30793	250 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ADIPOQ	Q15848	244 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PIGC	Q92535	297 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CKLF	Q9UBR5	152 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	DUSP13	Q9UII6	198 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421		A1L4Q6	167 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SULT1B1	O43704	296 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	UTS2B	Q765I0	119 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	SPACA5	Q96QH8	159 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		15.17	■□□□□ 0.02

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