RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637823.1

CLN6-223, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, human

TSL 5

Gene CLN6, Length 717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN6-223	ENST00000637823	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823		B8ZZF3	427 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	HPGDS	O60760	199 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CST4	P01036	141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CRYAA	P02489	173 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	FAM157B	P0CG42	384 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	BMP4	P12644	408 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	RAC2	P15153	192 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SELE	P16581	610 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	PRKACB	P22694	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	HTR2C	P28335	458 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	EVX1	P49640	407 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ZNF45	Q02386	682 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	RIN1	Q13671	783 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	IGFBP7	Q16270	282 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	FTMT	Q8N4E7	242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	PIGC	Q92535	297 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR51B6	Q9H340	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	PAH	P00439	452 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	APOA1	P02647	267 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	THBD	P07204	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	HCK	P08631	526 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	AGA	P20933	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CALCR	P30988	508 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	GPR173	Q9NS66	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	CAD	P27708	2225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823		A0A0B4J203	849 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CLN6-223	ENST00000637823	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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