RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PIGT	Q969N2	578 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NELFA	Q9H3P2	528 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0J9YW62	118 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	EFS	O43281	561 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	HTR3B	O95264	441 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	F10	P00742	488 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	GJC3	Q8NFK1	279 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MITD1	Q8WV92	249 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF75A	Q96N20	296 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.51	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SCGN	O76038	276 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CD8A	P01732	235 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	AGTR1	P30556	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FGL1	Q08830	312 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	EXT1	Q16394	746 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	KCNMB1	Q16558	191 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NCOR1	O75376	2440 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JMM0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPB8	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRS3	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	DHH	O43323	396 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CD63	P08962	238 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FCGR2A	P12318	317 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	DLST	P36957	453 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ST8SIA2	Q92186	375 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PTGFR	P43088	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR10A2	Q9H208	303 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.5	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		M0R135	149 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PLAT	P00750	562 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	CCL1	P22362	96 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OTX2	P32243	289 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF799	Q96GE5	643 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WZY1	265 aa		11.49	□□□□□ -0.57
BRF1-222	ENST00000635152	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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