RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 FAM57BQ71RH2 274 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ASRGL1Q7L266 308 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 DOK3Q7L591 496 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 GID4Q8IVV7 300 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OR8S1Q8NH09 359 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TMEM163Q8TC26 289 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OTULINQ96BN8 352 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 PGAM5Q96HS1 289 aa7.57□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 TBX1O43435 398 aa7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 ACTR3P61158 418 aa7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 KRT77Q7Z794 578 aa7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 THEM6Q8WUY1 208 aa7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 OR8B4Q96RC9 309 aa7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OCEL1Q9H607 264 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 FAM206AQ9NX38 181 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.56□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 WDR82Q6UXN9 313 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.55□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 CLN6Q9NWW5 311 aa7.55□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 A6NLC8 198 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 DHRS3O75911 302 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ACKR3P25106 362 aa7.54□□□□□ -1.2
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PKP4-218ENST00000629219 MTNR1AP48039 350 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 MICBQ29980 383 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 FAM201AQ5SY85 155 aa7.54□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.54□□□□□ -1.2
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