RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PMP2P02689 132 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 GUSBP08236 651 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CD34P28906 385 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PRKXP51817 358 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 BPIFB3P59826 476 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ACTBP60709 375 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ACTG1P63261 375 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 FOXK1P85037 733 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF345Q14585 488 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CATSPERDQ86XM0 798 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CHST5Q9GZS9 411 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 HHLA2Q9UM44 414 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 WIPF3A6NGB9 483 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 A8MVM7 634 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SULT2B1O00204 365 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 HOXB5P09067 269 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PI3P19957 117 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 HOXA5P20719 270 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 GLP1RP43220 463 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 FASLGP48023 281 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SLC6A8P48029 635 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ATP1B3P54709 279 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TDGQ13569 410 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 RSU1Q15404 277 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 FJX1Q86VR8 437 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 POM121Q96HA1 1249 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 RHOFQ9HBH0 211 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 VSIG4Q9Y279 399 aa9.5□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 NUDT19A8MXV4 375 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ALG1L2C9J202 215 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TSPAN2O60636 221 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 MED6O75586 246 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 IFNA2P01563 188 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 IFNA10P01566 189 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ITGB2P05107 769 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 H2BFMP0C1H6 154 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CD38P28907 300 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CASRP41180 1078 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PKIAP61925 76 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 COX15Q7KZN9 410 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CST11Q9H112 138 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 HRH4Q9H3N8 390 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 TSTD3H0UI37 97 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 DAOP14920 347 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ANOS1P23352 680 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CDAP32320 146 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PMELP40967 661 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CFHR1Q03591 330 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R1AQ13522 171 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 OR8G1Q15617 311 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 FAM166AQ6J272 317 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 GKN2Q86XP6 184 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 CARFQ8N187 725 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 WNT5BQ9H1J7 359 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 LRP4O75096 1905 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 SPTA1P02549 2419 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.49□□□□□ -0.89
FCHO1-216ENST00000596536 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms