RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF843Q8N446 348 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 WDR31Q8NA23 367 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 FAM222BQ8WU58 562 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SGCDQ92629 289 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PIGTQ969N2 578 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SPSB4Q96A44 273 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SPSB1Q96BD6 273 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 EDARQ9UNE0 448 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.34□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.34□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GGT3PA6NGU5 568 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GABRPO00591 440 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TBX1O43435 398 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TTRP02766 147 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ALDOBP05062 364 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 UBBP0CG47 229 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SRMP19623 302 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RAB3AP20336 220 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CCNOP22674 350 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GNLYP22749 145 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GADD45AP24522 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GLRXP35754 106 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TGFBR2P37173 567 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CRYBB2P43320 205 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 EVX1P49640 407 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FAM27E3Q08E93 113 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SSX1Q16384 188 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LCE1DQ5T752 114 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LCE4AQ5TA78 99 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 KRT74Q7RTS7 529 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 C1QL4Q86Z23 238 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NUP37Q8NFH4 326 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM106AQ96A25 262 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 REEP6Q96HR9 211 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CMTM3Q96MX0 182 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DIRC2Q96SL1 478 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 AMELYQ99218 206 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TPK1Q9H3S4 243 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RHOFQ9HBH0 211 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GPR84Q9NQS5 396 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GHRLQ9UBU3 117 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PLCE1Q9P212 2302 aa6.33□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LRRK2Q5S007 2527 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PLSCR5A0PG75 271 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS44E7EML9 344 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 E9PI62 339 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 H3BMQ9 156 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PSMD9O00233 223 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GMDSO60547 372 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TSC22D2O75157 780 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SC5DO75845 299 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SCGNO76038 276 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CYB5AP00167 134 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CST4P01036 141 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CD3EP07766 207 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF35P13682 527 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PLA2G2AP14555 144 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RAB3BP20337 219 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NR4A1P22736 598 aa6.32□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TNFSF4P23510 183 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms