RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.85□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WWC5 75 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WZY1 265 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 LIPT2A6NK58 231 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 B4DEV8 164 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 H0Y8X5 98 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 VAMP5O95183 116 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CDS2O95674 445 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 MPIG6BO95866 241 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 HBE1P02100 147 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 PMP2P02689 132 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 HCKP08631 526 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF806P0C7X5 589 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 DANCRP0C864 163 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GNB3P16520 340 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 COL9A1P20849 921 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CHATP28329 748 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 NPBWR1P48145 328 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CLRN1P58418 232 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GABREP78334 506 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXK1P85037 733 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 BEX5Q5H9J7 111 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 MARCH3Q86UD3 253 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 UEVLDQ8IX04 471 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 NKD1Q969G9 470 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM230Q96A57 120 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 GPER1Q99527 375 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 HRH4Q9H3N8 390 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 STARD5Q9NSY2 213 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 EHFQ9NZC4 300 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.84□□□□□ -1.31
CAPNS1-202ENST00000586851 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WV48 116 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GX78 115 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPC4 97 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MS4A18H0YCH9 400 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 H0YIZ8 118 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 AP4M1O00189 453 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPA12AO43301 675 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SGCEO43556 437 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 DNPH1O43598 174 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 LRP3O75074 770 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV3-1P01715 115 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 FABP1P07148 127 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 DUSP1P28562 367 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 FCGR2CP31995 323 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SNCAP37840 140 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGFRP43088 359 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1D4P47884 311 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A10P60903 97 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB32Q13637 225 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8G1Q15617 311 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 NSDHLQ15738 373 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52W1Q6IF63 320 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZRG5 221 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 COX15Q7KZN9 410 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5AS1Q8N127 324 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 LGI3Q8N145 548 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.83□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.83□□□□□ -1.32
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