RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 GMDSO60547 372 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMX1BO60663 402 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNFRSF1AP19438 455 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYF6P23409 242 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCKP27707 260 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM33P57088 247 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACTA2P62736 377 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACTG2P63267 376 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPPED2Q15777 294 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SGCDQ92629 289 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM80Q96HE8 168 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 JAM3Q9BX67 310 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 HTR1AP08908 422 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAHP16930 419 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD200P41217 278 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP2K3P46734 347 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRDX4Q13162 271 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 AHSA2Q719I0 299 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYS1Q8N2H4 156 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNBD2Q96M20 576 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC22A4Q9H015 551 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTGES3LE9PB15 166 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF205O95201 554 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CST4P01036 141 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRPP07492 148 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL2RGP31785 369 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPA13P48723 471 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 XAF1Q6GPH4 301 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR86Q86TI4 376 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 V9GYS6 101 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 IRGMA1A4Y4 181 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLDN25C9JDP6 229 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC1A7O00341 560 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 DHRS3O75911 302 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOSL1P15407 271 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNALP38405 381 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEP78Q5JTW2 689 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM201AQ5SY85 155 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FDX2Q6P4F2 183 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR8S1Q8NH09 359 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITPKCQ96DU7 683 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A1B0GVI7 797 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYT7O43581 403 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYL12AP19105 171 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCL1P22362 96 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 THBS2P35442 1172 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 DOC2BQ14184 412 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 MOB3CQ70IA8 216 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 DOK3Q7L591 496 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 STX19Q8N4C7 294 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAB26Q9ULW5 256 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.7□□□□□ -0.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms