RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 BATF2Q8N1L9 274 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CACNA1GO43497 2377 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 TNFSF15O95150 251 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 IL5P05113 134 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ZNF883P0CG24 379 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 FCGR2AP12318 317 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CPN1P15169 458 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CXCL2P19875 107 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ACKR3P25106 362 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 AVPR2P30518 371 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SPEM2Q0P670 501 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 POU4F3Q15319 338 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 HES3Q5TGS1 186 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SGK3Q96BR1 496 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 IFT46Q9NQC8 304 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 GPR173Q9NS66 373 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 VSIG4Q9Y279 399 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SNRPGP15A8MWD9 76 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CCSO14618 274 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SGCEO43556 437 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SLC22A5O76082 557 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RGS11O94810 467 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 LCATP04180 440 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RAB6AP20340 208 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 MAGEA5P43359 124 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SULF2Q8IWU5 870 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 GPR137CQ8N3F9 429 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SUN5Q8TC36 379 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RAB3CQ96E17 227 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 MED30Q96HR3 178 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.3□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 A0A096LPE4 126 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 A0A1W2PPZ6 126 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SULT1C2O00338 296 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ANGPTL7O43827 346 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 TPOP07202 933 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 DCAF10Q5QP82 559 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 FAM27BQ5VT28 67 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 RAB12Q6IQ22 244 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 PGAP1Q75T13 922 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 PTX4Q96A99 478 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SEC22AQ96IW7 307 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ADGRG7Q96K78 797 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 EDEM2Q9BV94 578 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 EMC3Q9P0I2 261 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OR14I1A6ND48 311 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 DHRS3O75911 302 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 NR2C1P13056 603 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CCL2P13500 99 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 PI3P19957 117 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CNR1P21554 472 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CCL1P22362 96 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 CCNOP22674 350 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 GFRA1P56159 465 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 GNG2P59768 71 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OR1C1Q15619 314 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SPICQ8N5J4 248 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ZPBPQ9BS86 351 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 DDA1Q9BW61 102 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OPN4Q9UHM6 478 aa9.29□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 OR2AT4A6NND4 320 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 ALX3O95076 343 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 AKR1C4P17516 323 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 SPINK2P20155 84 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 PTGFRP43088 359 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 HTR5AP47898 357 aa9.28□□□□□ -0.92
CUX1-217ENST00000558836 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms