RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 V9GYS6 101 aa18.26■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 PTPRBP23467 1997 aa18.26■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 LPLP06858 475 aa18.26■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.26■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa18.26■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 STEAP1BQ6NZ63 245 aa18.26■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 GABRG1Q8N1C3 465 aa18.26■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 FAM117AQ9C073 453 aa18.26■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 MCEMP1Q8IX19 187 aa18.25■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa18.24■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 CDC14BO60729 498 aa18.24■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.23■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
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PRDM4-205ENST00000550376 APOC1P02654 83 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 THBS4P35443 961 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 HIKESHIQ53FT3 197 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 FGD2Q7Z6J4 655 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 UXS1Q8NBZ7 420 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 CHIAQ9BZP6 476 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 TAS2R8Q9NYW2 309 aa18.22■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 C5orf49A4QMS7 147 aa18.21■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 RAD51DO75771 328 aa18.21■□□□□ 0.51
PRDM4-205ENST00000550376 ACTL6AO96019 429 aa18.21■□□□□ 0.51
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