RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	PRDX4	Q13162	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	LYZL4	Q96KX0	146 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	FAM157A	C9JC47	383 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059		E9PQ18	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DHRS3	O75911	302 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF205	O95201	554 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	TTR	P02766	147 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	GABRB1	P18505	474 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF85	Q03923	595 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	MPPED2	Q15777	294 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	DOK3	Q7L591	496 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	BEX2	Q9BXY8	128 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	RNF7	Q9UBF6	113 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CHID1-222	ENST00000533059	IRGM	A1A4Y4	181 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		J3QLW9	94 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	P2RY10	O00398	339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CLIC3	O95833	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PNP	P00491	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CST4	P01036	141 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF19	P17023	458 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ACKR3	P25106	362 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CAPG	P40121	348 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LMO4	P61968	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RAB40B	Q12829	278 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	IL18R1	Q13478	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		Q8TCH9	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RNF170	Q96K19	258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	C4orf36	Q96KX1	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MTOR	P42345	2549 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		H3BSH0	61 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DLGAP1	O14490	977 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SYT7	O43581	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CRLF1	O75462	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	FOXH1	O75593	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	HTR1A	P08908	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	FAH	P16930	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CD80	P33681	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PSMB10	P40306	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MED21	Q13503	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CR1L	Q2VPA4	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MOB3C	Q70IA8	216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55

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