RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528150.1

USP33-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, human

TSL 3

Gene USP33, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP33-215	ENST00000528150	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	AMELY	Q99218	206 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150		A0A0U1RQV5	110 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	PRKY	O43930	277 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	CIB1	Q99828	191 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP33-215	ENST00000528150	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ADAM20	O43506	726 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LIPF	P07098	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ADRA2C	P18825	462 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PMEL	P40967	661 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ROM1	Q03395	351 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TMED1	Q13445	227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PIGC	Q92535	297 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21	1e-5	■□□□□ 9.3
USP33-215	ENST00000528150	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CST4	P01036	141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	KRT8	P05787	483 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CD80	P33681	288 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	CXCR4	P61073	352 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ACTG1	P63261	375 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	EGR3	Q06889	387 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PRDX4	Q13162	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	RNF170	Q96K19	258 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	AVP	P01185	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	MTNR1A	P48039	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	HCCS	P53701	268 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	HILS1	P60008	231 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	PKP2	Q99959	881 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP33-215	ENST00000528150	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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