RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	C6orf50	Q9HD87	102 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	IFT46	Q9NQC8	304 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CD274	Q9NZQ7	290 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702		Q9UF83	564 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FAM49B-222	ENST00000522702	CHD4	Q14839	1912 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0A6YYH2	397 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NJ64	397 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		H0YHG0	523 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		H7C1H1	209 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		M0QXV9	152 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	EMC8	O43402	210 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAP1	O75689	374 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO1D	O94832	1006 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	UTS2	O95399	124 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CTDNEP1	O95476	244 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GP1BA	P07359	652 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	LIPC	P11150	499 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	HLA-G	P17693	338 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	F2R	P25116	425 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GDF1	P27539	372 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MAS1L	P35410	378 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PRLHR	P49683	370 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	XK	P51811	444 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	AP1S2	P56377	157 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPAN5	P62079	268 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CTAG1A	P78358	180 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMG2	Q02383	582 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	STX4	Q12846	297 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	AQP6	Q13520	282 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TPBG	Q13641	420 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PRPSAP1	Q14558	356 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RESP18	Q5W5W9	173 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DOK4	Q8TEW6	326 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ESR2	Q92731	530 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3GL3	Q99963	347 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	COA1	Q9GZY4	146 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	REEP1	Q9H902	201 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		3.02	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	NID2	Q14112	1375 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ELP1	O95163	1332 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NDN8	102 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		H3BQV1	296 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB3D	O95716	219 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ACTL6A	O96019	429 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	COX7A1	P24310	79 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	HRH1	P35367	487 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CEACAM3	P40198	252 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	EMP2	P54851	167 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FLOT2	Q14254	428 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DMC1	Q14565	340 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FHL5	Q5TD97	284 aa		3.01	□□□□□ -1.93

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