RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NPIPB4-205	ENST00000520808	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	P2RY10	O00398	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	PSPN	O60542	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB3D	O95716	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CYB5A	P00167	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	HP	P00738	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	TTR	P02766	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808		P04436	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ALDOB	P05062	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CHRM2	P08172	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	QDPR	P09417	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	UBB	P0CG47	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF28	P17035	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	MSR1	P21757	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CTSS	P25774	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SRD5A2	P31213	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SFTPD	P35247	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	VEGFC	P49767	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF84	P51523	738 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CLDN17	P56750	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	FOXL2	P58012	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAP2B	P61225	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	PMPCA	Q10713	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SSPN	Q14714	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	DOK3	Q7L591	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	FGGY	Q96C11	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPR137	Q96N19	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	GLTP	Q9NZD2	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808		H3BSH0	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	DHH	O43323	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	DOK2	O60496	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	RGS11	O94810	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	KDM4B	O94953	1096 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNA7	P01567	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	RLN1	P04808	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	TPO	P07202	933 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	TBP	P20226	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NPIPB4-205	ENST00000520808	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms