RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	LHX4	Q969G2	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	RCN3	Q96D15	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	COG8	Q96MW5	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A1B0GUS0	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965		F5H5K5	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965		G3V4G9	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	P2RY10	O00398	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	CXCR6	O00574	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	NME4	O00746	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TIMM23	O14925	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ADAM20	O43506	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	OR10H3	O60404	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	KRT34	O76011	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	DIRAS1	O95057	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	NDUFB2	O95178	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	FSTL3	O95633	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SERPINA1	P01009	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IFNA14	P01570	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	GYPA	P02724	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TFF1	P04155	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IRF2	P14316	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	NCK1	P16333	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	CA6	P23280	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	CD200	P41217	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IER3	P46695	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	OMP	P47874	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	COX10	Q12887	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	KLRD1	Q13241	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SEC23B	Q15437	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	OR8B8	Q15620	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	TAF9	Q16594	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965		Q6ZSV7	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	LNX2	Q8N448	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	PNKD	Q8N490	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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