RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498801.5

GARNL3-222, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-222ENST00000498801 CSNK2BP67870 215 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 MED21Q13503 144 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 KLHL22Q53GT1 634 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF786Q8N393 782 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR2T27Q8NH04 317 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 THEM6Q8WUY1 208 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 AMELYQ99218 206 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 TBX5Q99593 518 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 SCN3BQ9NY72 215 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 COPS3Q9UNS2 423 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PDZD2O15018 2839 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 DAPL1A0PJW8 107 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 C5orf49A4QMS7 147 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 DPRXA6NFQ7 191 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PRR32B1ATL7 298 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF878C9JN71 531 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 J3KRW8 73 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 CRYAAP02489 173 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 CSF1P09603 554 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 CCDC159P0C7I6 412 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 COX5BP10606 129 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 CCL2P13500 99 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 PAX1P15863 534 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 APLNRP35414 380 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OPRL1P41146 370 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 NAAAQ02083 359 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF85Q03923 595 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 BSPH1Q075Z2 132 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ECH1Q13011 328 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 TAF13Q15543 124 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 AHSA2Q719I0 299 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 SSX6Q7RTT6 188 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 KRT77Q7Z794 578 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 Q8N1X5 172 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 GGHQ92820 318 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 SPTSSAQ969W0 71 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 OR8B4Q96RC9 309 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 COQ7Q99807 217 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 ATF6BQ99941 703 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 COPS4Q9BT78 406 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 CENPMQ9NSP4 180 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-222ENST00000498801 NOTCH2Q04721 2471 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 SHISA9B4DS77 424 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 PTGES3LE9PB15 166 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 ABCD4O14678 606 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 HS3ST1O14792 307 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF254O75437 659 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 ADRA2AP08913 450 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 H2BFMP0C1H6 154 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 ZNF35P13682 527 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 MYL12AP19105 171 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-222ENST00000498801 CCNOP22674 350 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms