RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496329.1

RNF207-208, Transcript of ring finger protein 207, human

TSL 3

Gene RNF207, Length 231 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF207-208	ENST00000496329	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FBXW5	Q969U6	566 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GABRP	O00591	440 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	LMX1B	O60663	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CD8A	P01732	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CD37	P11049	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FST	P19883	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	MAGEB1	P43366	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	INSL4	Q14641	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329		Q6ZR03	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	OR14A2	Q96R54	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GMDS	O60547	372 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FAH	P16930	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SSTR2	P30874	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	MUC15	Q8N387	334 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FGGY	Q96C11	551 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GABARAP	O95166	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CD2	P06729	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SOD3	P08294	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	GADD45A	P24522	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PRSS12	P56730	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	ABCA4	P78363	2273 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RNF207-208	ENST00000496329	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	OVOL3	O00110	214 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	MLNR	O43193	412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	ALDOB	P05062	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	CD55	P08174	381 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	SOX2	P48431	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	PPOX	P50336	477 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	CTF1	Q16619	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNF207-208	ENST00000496329	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms