RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494424.1

TSPAN6-202, Transcript of tetraspanin 6, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN6, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6-202ENST00000494424 GINS1Q14691 196 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MFSD13AQ14CX5 517 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ESCO2Q56NI9 601 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SYT14P1Q58G82 188 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 OAFQ86UD1 273 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SPICQ8N5J4 248 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SCAIQ8N9R8 606 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 OR4Q3Q8NH05 313 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TAAR8Q969N4 342 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SAMD8Q96LT4 415 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MOGAT1Q96PD6 335 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TEX12Q9BXU0 123 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 FN3KQ9H479 309 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NANSQ9NR45 359 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 FKBP14Q9NWM8 211 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 UPB1Q9UBR1 384 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SCOCQ9UIL1 159 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.13□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 KMT2AQ03164 3969 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 A0A1B0GW55 424 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MCIDASD6RGH6 385 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 M0R129 80 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IMPA2O14732 288 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ARPC3O15145 178 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IDH3BO43837 385 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 PRKYO43930 277 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IGKV3-15P01624 115 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 HMGN1P05114 100 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CD28P10747 220 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NR4A1P22736 598 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SHC1P29353 583 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 FMO3P31513 532 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MAGEB1P43366 347 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TUBA4AP68366 448 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 PAX2Q02962 417 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SNAPC1Q16533 368 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ALG10Q5BKT4 473 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ZNF773Q6PK81 442 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 FAM122BQ7Z309 247 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 LRRC75AQ8NAA5 344 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 OR5J2Q8NH18 312 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 TMEM163Q8TC26 289 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 Q96MT0 163 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 IFT27Q9BW83 186 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CMC2Q9NRP2 79 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CLN6Q9NWW5 311 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TSPAN6-202ENST00000494424 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms