RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 KRT77Q7Z794 578 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FGFRL1Q8N441 504 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 SPERTQ8NA61 448 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8S1Q8NH09 359 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 UPRTQ96BW1 309 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ITPKCQ96DU7 683 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TECTBQ96PL2 329 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 RGCCQ9H4X1 137 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 SP140LQ9H930 580 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 KRT84Q9NSB2 600 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM206AQ9NX38 181 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4Q9UBX2 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ZAR1LA6NP61 321 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 G3V2T6 193 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TRIM77I1YAP6 450 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ADAM20O43506 726 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 LHBP01229 141 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FPR2P25090 351 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FASP25445 335 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 GNALP38405 381 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 RASSF2P50749 326 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FGF12P61328 243 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 MZT1Q08AG7 82 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 POU4F2Q12837 409 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PRDX4Q13162 271 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 C12orf73Q69YU5 71 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 WDR82Q6UXN9 313 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DOK3Q7L591 496 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 LRRC29Q8WV35 223 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 SEH1LQ96EE3 360 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX5Q96PT3 197 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8B4Q96RC9 309 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 JMJD8Q96S16 334 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TEAD3Q99594 435 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CIB1Q99828 191 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PKP2Q99959 881 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TEX12Q9BXU0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 NIPAL2Q9H841 368 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 HAX1O00165 279 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CDIPTO14735 213 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ATP5HO75947 161 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PLATP00750 562 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CST4P01036 141 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 IGLV3-1P01715 115 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 SFTPBP07988 381 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 FCGR1AP12314 374 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 NPY4RP50391 375 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 GMFBP60983 142 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 EFNB1P98172 346 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ROM1Q03395 351 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNJ8Q15842 424 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 WDR38Q5JTN6 314 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms