RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FGF17O60258 216 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GOSR1O95249 250 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 HKR1P10072 659 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NR2F1P10589 423 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DPP4P27487 766 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DUSP2Q05923 314 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF774Q6NX45 483 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ADCK2Q7Z695 626 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SYT9Q86SS6 491 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 BAP18Q8IXM2 172 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MOAP1Q96BY2 351 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CSTL1Q9H114 145 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 COMMD9Q9P000 198 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 A0A0G2JN53 185 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ARL6IP5O75915 188 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MELTFP08582 738 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CTXN2P0C2S0 81 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FBXO45P0C2W1 286 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CPMP14384 443 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GZMHP20718 246 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NT5EP21589 574 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 BTN3A2P78410 334 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TSPAN31Q12999 210 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR4K15Q8NH41 348 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC35A4Q96G79 324 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 VSTM2LQ96N03 204 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.8□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CCL25O15444 150 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FBXO24O75426 580 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PPP1R3DO95685 299 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OPN1MWP04001 364 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FCGR3AP08637 254 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DCAF7P61962 342 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TAF13Q15543 124 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GXYLT1Q4G148 440 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 AWAT1Q58HT5 328 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TMEM99Q8N816 258 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 Q8NA96 180 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TMEM19Q96HH6 336 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR5B2Q96R09 309 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 S100A13Q99584 98 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PROK2Q9HC23 129 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DAPL1A0PJW8 107 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 H7C417 338 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 M0QZK8 103 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 KCNAB3O43448 404 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR1D4P47884 311 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GHSRQ92847 366 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MR1Q95460 341 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DERL3Q96Q80 235 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CHST6Q9GZX3 395 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FRG2CA6NGY1 282 aa6.79□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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