RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 GPR160Q9UJ42 338 aa11.02□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.02□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CACNG2Q9Y698 323 aa11.02□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ITPR3Q14573 2671 aa11.02□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MAST4O15021 2626 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 A0A096LNT2 108 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 PLSCR5A0PG75 271 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 H3BSH0 61 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 RGS10O43665 173 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ATP6V1B1P15313 513 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 FAHP16930 419 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MAP2K4P45985 399 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 WNT4P56705 351 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GABARAPL2P60520 117 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 PCGF3Q3KNV8 242 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 Q5PR19 223 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 DOK3Q7L591 496 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZNF525Q8N782 197 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ITPKCQ96DU7 683 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 DIRC2Q96SL1 478 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 DCAF16Q9NXF7 216 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 IL19Q9UHD0 177 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CR1P17927 2039 aa11.01□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 A6NIN4 97 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 VWC2LB2RUY7 222 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SSX4O60224 188 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GMDSO60547 372 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 DAOP14920 347 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 PCMT1P22061 227 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ACHEP22303 614 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GIFP27352 417 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CD200P41217 278 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CRYBB2P43320 205 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GATA4P43694 442 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MAP2K3P46734 347 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CDH15P55291 814 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 PRDX4Q13162 271 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 RIN1Q13671 783 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZBTB37Q5TC79 503 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ITLN1Q8WWA0 313 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 OR5P3Q8WZ94 311 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MEGF10Q96KG7 1140 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 OR2V2Q96R30 315 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 GCM1Q9NP62 436 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ERGIC3Q9Y282 383 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 PIGLQ9Y2B2 252 aa11□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CREBBPQ92793 2442 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 TMEM212A6NML5 194 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZNF850A8MQ14 1090 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SYT7O43581 403 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 PLPP2O43688 288 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CD1AP06126 327 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 THBS2P35442 1172 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 BDH1Q02338 343 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SPHARQ15513 63 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MPPED2Q15777 294 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZMAT1Q5H9K5 638 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 TMEM244Q5VVB8 128 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SHEQ5VZ18 495 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SPARTQ8N0X7 666 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 OR5AK2Q8NH90 309 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 RDH5Q92781 318 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SMIM19Q96E16 107 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 MND1Q9BWT6 205 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 SLC22A4Q9H015 551 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa10.99□□□□□ -0.65
GINS1-204ENST00000484893 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms